皇慶元年(1312)，入朝任國子司業。他上任的第一件事，是建議改革學校的管理。當權者因循守舊，與他意見不合，文原便借病辭職。實行科舉考試制，文原出任江浙行省主考官，為防止考生們守舊的陋習，將朱熹的《貢舉私議》一文書寫，貼在考場門口。延四年(1317)，升為翰林待制。五年，出僉江南浙西道肅政廉訪司事。平江有一僧人，與該府判官理熙有私怨，收買其徒弟控告理熙貪贓，熙被迫認罪，文原巡察時，審問得其實情，將那個誣告和尚施以杖刑，釋放了理熙。吳興百姓夜間回家，巡邏者逮捕綁于亭下，此人逃走了。追趕的人將他在途中刺死。其兄問殺人者是什么模樣，有人說是個高個子人，頭戴白帽，身穿青衣。其兄向官府投訴，官府問初更值班者是誰，回答是張福兒，于是逮捕審問，強行認罪，把他囚禁了三年。文原察覺原判不實，福兒身不滿六尺，并非高個子；死者刀傷在右脅，而福兒一貫是用左手，傷應在左脅。經過調查，捕獲真正的兇手，福兒得以釋放。桐廬人戴汝惟家被盜，官府捕獲了盜賊，審理后送到郡衙處治。夜間戴家房屋被焚，汝惟下落不明。文原認為其中必有緣故，經訪察，得汝惟之妻葉氏與其弟謀殺汝惟的罪狀，又在水塘邊的樹下發現了汝惟的尸體和行兇的斧頭，證實了案情，人們把文原當作是神。
六年，調僉江東道肅政廉訪司事。該道之徽州、寧國、廣德三郡每年征收茶課鈔原為三千錠，后增至十八萬錠，把山谷中所出產的茶葉都送交，也不到一半，其余都是另向民間勒索的，而且年年如此。當時，轉運司的官吏，任用鄉間奸狡之徒，動不動以犯法罪誣陷百姓，而且轉運司對當地官府實行專制，凡五品以下的官員都可以判以杖刑，州縣把他們無可奈何。文原奏請廢除專收茶課的轉運司，讓郡縣自己征收上交。但這建議未能呈送到朝廷。徽州民謝蘭的家僮汪某被人殺死，蘭之侄謝回買通汪族人，誣告蘭是兇手，蘭被迫服罪。文原復審，得以昭雪，判謝回之罪。
至治二年(1322)，入朝為集賢直學士。地震，朝廷詔令朝臣擬定消災的辦法。文原奏請判決尚在關押的囚犯；在河北設置倉廩，存儲糧食以備荒年。再次請求廢除榷茶轉運司，但此條陳仍未上報皇帝。三年，兼任國子監祭酒。江浙省臣趙簡奏請開經筵，為皇帝講解經史。泰定元年(1324)，任命文原兼經筵講官，他因病請求辭職歸家。二年，召入朝拜翰林侍講學士，又以疾病而辭謝。三年，拜嶺北湖南道肅政廉訪使，因病未赴任。天歷元年(1328)卒，終年七十歲。
文原內嚴厲而外寬恕，家貧而為官廉潔。早年客居京師時，有一書生病重，從袋中取出一金，囑托文原將此金交給他家屬。此書生病逝，而同房一書生把那金子偷走了，文原另買同量的金子給死者家屬，此事他終身未同人說起。有文集若干卷，藏于家中。至順四年(1333)，贈江浙行省參知政事，謚“文肅”。
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