祝欽明參加明經科考試中選，任東臺典儀。高宗永淳至武則天天授年間，又先后參加英才杰出、業奧“六經”等科考試中選，授予著作郎，任太子率更令。
中宗李顯退位當皇太子時，祝欽明兼任侍讀，給太子講授儒家經典，兼任弘文館學士。中宗復位后，提拔為國子祭酒、同中書門下三品。后來升任禮部尚書，封為魯國公，得到收納三百戶租稅的實封。
桓彥范、崔玄日韋、袁恕己、敬暉等人都跟著他學習《周禮》的主要內容，朝廷敬重他。因為隱瞞父母去世的日期，被御史中丞蕭至忠彈劾，貶為申州刺史。后來調回朝廷任國子祭酒。
景龍三年(709)，中宗準備到京城南郊祭祀天地，祝欽明和國子司業郭山惲暗中迎合韋皇后的心意，錯誤地建議說：“《周禮》把敬天神叫作祀，敬地神叫作祭，敬祖先叫作享。《大宗伯》篇說：祀天神，祭地，享祖先，君主有緣故不親自參加，就派人代理祭獻。追師掌管王后的禮帽，準備參加祭祀。內司服掌管王后的衣、衤俞狄、闕狄、鞠衣、展衣、緣衣這六種禮服，祭祀時就供她穿戴。還有宮中女官，凡有大祭祀活動，王后用酒祭奠祖先時她們就幫忙遞送酒杯。這樣看來，王后就應當協助君主祀天神、祭地。鄭玄聲稱：闕狄，這是王后協助君主舉行小祭祀的禮服。小祭祀尚且需要王后助祭，何況是祭祀天地呢？闕狄以上，衣、衤俞狄，這三種禮服都是用來協助祭祀的，可見衣是用來協助大祭祀的。
君主的祭服有兩種：叫作先王袞冕，先公冕。所以王后協助祭祀，也穿衣祭先王，穿衤俞狄祭先公。這里沒談協助祭祀天地，是舉個例子來說明全部規章制度，叫作舉一反三。《春秋外傳》說：‘郊外祭祀，天子親自射所用的牛，王后親自舂所用的稷。’女官王后參與祭禮，不只是主持祭祀祖先。《祭統》說：‘祭祀，必須夫妻親自參加，以便警戒宮廷內外的官員。’魯哀公詢問孔子說‘：君主親自迎親，不是太隆重了嗎？’孔子回答說：‘男女結婚，為先王傳宗接代，永遠當國家朝廷的主宰，您怎么說這樣太隆重了呢？’由此可知皇后應當協助祭祀。我們請求按照經書的義理，制定禮儀規章。”
中宗雖然并不精明，還是疑惑不定，招見禮部官員咨詢。這時太常博士唐紹、蔣欽緒回答說：“祝欽明引證的，都是祭祀祖先的禮儀，不是祭祀天地的規章。
北周、隋朝以前，沒有皇后協助祭祀天地的先例。”中宗叫宰相們評議論證，唐紹、蔣欽緒又引薦博士彭景直一起評議說：“《周禮》所講的祀、祭、享，都是同義詞。《典瑞》說‘：兩次獻酒來“祀”地神。’《司幾筵》說：‘擺設“祀”先王的席位。’《內宗》說‘：掌管宗廟的祭“祀”。’書傳里說‘：圣人才能“享”天神。’‘春季、秋季祭祀天地，按時思念神靈。’這里就是把祀天稱為‘享’天，享廟稱為‘祭’廟的例證。
禮儀家凡是稱作大祭祀的，不僅僅是祭祀天神。《郁人》說：‘大祭祀，主管祭器的官員郁人和掌管行政區劃的官員量人擔任祭祀副職。’祭天是不用獻酒的，那么宮中女官幫忙遞送酒器，祭祀祖先也叫大祭祀。祝欽明根據《大宗伯》的職責，來斷定皇后應當參加祭天地的禮儀。
據經典記載‘：凡是祀天神、祭地、享祖先，帶領辦事人員占卜齋戒住所，檢查洗滌祭品，督促洗滌祭器，察看烹煮牲畜的鼎鍋，清點盛黍稷的玉器，擬訂堂皇的名號。如果君主不參加祭祀活動，就派人代理他的職責。’從以上所舉例證類推，是統稱君主祭祀天地祖先。下邊還講：‘凡是大祭祀活動，王后不參加，就派人代理獻酒。’只是王后祭祀祖先的一個例證而已。如果應當協助祭祀天地，就不會分述大祭、中祭、小祭。并且王族女兒、君主的外甥女兒主管的，都是幫忙王后祭祀祖先，沒有幫助祭祀天地的說法。
如果王后協助祭祀天地，誰當她的助手呢？那么這里說的代理獻酒是指祭祀祖先就明確得很。內司服管理的王后祭服，并無祭天的禮服。禮儀家說明道：‘王后不參與祭祀天地五岳，所以沒有祭祀天地五岳的禮服。’又說‘：王后有五種大車，坐重翟陪同祭祀先王先公，坐厭翟陪同款待諸侯，坐安車早晚拜見君主，坐翟車采摘桑葉，坐輦車游樂飲宴。’根據這段記載，王后沒有祭天的大車明確得很。這樣看來，皇后協助君主祭祀天地，自古以來都沒有這種事。”
當時左仆射韋巨源幫助韋皇后挾制中宗，奪取政權，就幫忙祝欽明講話，中宗終于采納了他們的建議，命令韋皇后主持第二輪進獻儀式。叫來大臣李嶠等人的女兒擔任為韋皇后辦祭祀事務的齋娘，幫助祭祀。郊祭結束后，詔令已婚齋娘的丈夫都提升官職。
當初，韋皇后嫁給中宗當女官，到宮廷進獻食物，中宗和朝臣們飲宴，祝欽明自己說會跳八風舞，中宗同意他跳。祝欽明身體肥胖丑陋，蹲在地上搖著腦袋，鼓大眼睛，左顧右盼，中宗大聲歡笑。吏部侍郎盧藏用嘆惜說：“這種行為將《五經》的聲譽敗壞無余了！”睿宗景云初年，侍御史倪若冰彈劾說：“祝欽明、郭山惲等人是迂腐無用的儒生，行為惡劣，憑著諂媚奸巧擾亂法制改變規章，歷代君主的傳統，一下子就破壞丟棄了。如今我朝再次振興，不應讓小人留在朝廷，請把他們趕得遠遠的，來警戒不稱職的朝臣。”于是把祝欽明貶為饒州刺史，郭山惲貶為括州刺史。祝欽明對于《五經》精通淵博，自己卻因不孝獲罪而被罷官，無法洗清名聲，就奉承巴結韋皇后，希望重新任用，又因而獲罪被趕出朝廷，各儒生都為此感到羞愧。后來改任洪州都督，調回朝廷任崇文館學士，才死去。
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