隋文帝楊堅接受周靜帝的禪讓即皇帝位，封士文為上開府，賜爵為湖陂縣子，不久，任命他為貝州刺史。他清廉艱苦，不貪占公家的任何東西，家中沒有多余的錢財。他的兒子曾吃了官廚中的餅子，他便給兒子戴上枷鎖，關進監獄許多天，又打了二百棍，步行押送回京。家中的書僮奴仆沒有人敢輕易走出府門。家里吃的油鹽菜蔬，一定到他管轄的區域以外公平采買。府中有人出入，都要在門口登記，親朋故交都因此斷絕往來，慶賀吊唁，互不相通。他頒布了嚴刑峻法，官吏百姓有違法者，無不膽顫股栗。貝州境內，道不拾遺。就是有人犯了小的過失，他也要嚴加追究，決不寬貸。他曾回京城朝拜天子，正遇上隋文帝將國庫里的東西賞賜給公卿大臣，讓他們任意拿取。許多人都拿得又多又重，惟有士文用嘴咬著一匹絹，兩只手各拿了一匹。隋文帝問他為什么拿得這樣少，他答道：“我的口和手都得到滿足，其他就沒什么需求的。”隋文帝很驚異，另外賞賜給他一些東西。
他在州刺史任上，揭發并懲治那些丑惡奸邪的犯罪行為，官吏們有一尺布一斗粟的貪污或受賄，他也嚴懲不貸。共處治一千人，奏報給朝廷后，都發配到嶺南。為罪犯送行的親屬哭聲遍于貝州全境。這些人到了嶺南，遇上那里的由濕熱的空氣而傳染的疾病，十有八九都死掉了。于是，他們的父母兄弟，妻子兒女，都哭喊著厙狄士文的名字控訴叫罵。他聽說后，派人將他們捕來，鞭打棍擊，而哭喊的聲音更高。司馬京兆人韋棍、清河縣令河東人趙達，二人也都為政苛刻，只有長史惠愛百姓。當時人們傳說：“刺史為政就像閻羅王，司馬發怒好比蝮蛇瞪眼睛，只有長史對著百姓笑，清河這地方真是生吃活人。”隋文帝聽說后嘆息道“：士文的暴政超過了猛獸！”坐罪免去官職，不久，又被任命為雍州長史。他對別人說“：我過去立法嚴格，不能看貴臣顯要的眼色行事，不久一定會死在這個官位上！”上任后，執法嚴格公正，不回避勛臣貴戚，客人們不敢到他的家門請托，人們對他產生了埋怨的情緒。
他的從妹原來是北齊天子的嬪妃，頗有姿色。北齊滅亡后，被朝廷賜給了薛公長孫覽。長孫覽的妻子嫉妒，到文獻后那里進讒，讓長孫覽把士文的從妹休棄。士文感到很羞恥，不與他的從妹相見，后來，應州刺史唐君明在為母親守喪期間聘娶他的從妹為妻子。因此，他與君明都被御史彈劾。士文性情剛烈，在獄中被拘押數日，就憤恨死去。家中沒有多余的錢財，他有三個兒子，生活窮困，吃了上頓沒有下頓，親戚朋友卻沒有人幫助他們。
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